I doktorgradsavhandlingen har Bikal Ghimire fokusert på å identifisere effektorer hos algesopp som spiller en kritisk rolle i å svekke jordbærplantens forsvarssystem og fremme følsomhet for sykdommene rotstokkråte og lærråte.
Rotstokkråte og lærråte er to forskjellige sykdommer i jordbær forårsaket av to varianter av algesoppen Phytophthora cactorum. Angrep av disse skadegjørerne kan redusere avlingen så mye som opp mot 40% og utgjør en alvorlig risiko for produsentene.
Avhandlingen har tittelen:» Identifikasjon av effektorer hos den plantepatogene oomyceten Phytophthora cactorum og karakterisering av en resistensgenkandidat fra vertsplanten jordbær» og ble forsvart på Norges biovitenskapelige universitet (NMBU) 23. oktober 2023.
Smitteoverføring
I forskningen sin brukte Bikal Ghimire avanserte transkriptomiske og proteomiske metoder for å få en oversikt over mekanismene for infeksjon av P. cactorum. Forskningen hans fokuserte på å identifisere effektorene - molekyler som skilles ut av patogenet - som spiller en kritisk rolle i å svekke plantens forsvarssystem og fremme følsomhet for sykdom. Ghimires arbeid avdekket omtrent 700 potensielle effektorkandidater som kan bidra til patogenisiteten til P. cactorum. Disse inkluderte forskjellige enzymer, nekrose-induserende proteiner og andre molekyler som er kjent for å påvirke interaksjonen mellom patogenet og vertsplanten.
Ukjent jordbærgen
Et annet aspekt av Ghimires doktorgradsforskning er karakteriseringen av et tidligere ukjent jordbærgen FvCDIP1 (Fragaria vesca celle death inducing protein1). Dette genet ble utelukkende funnet i jordbærgenotyper som viste resistens mot P. cactorum. Etter ytterligere undersøkelser ble det påvist at FvCDIP1 ikke bare utløser celledød i en modellplanteart, men også øker plantens immunitet mot P. cactorum og et beslektet patogen, P. palmivora. Ghimires funn kan være viktig for fremtidig jordbærdyrking ved å bane vei for utvikling av sykdomsresistente jordbærsorter og en fremtidig bæredyktig jordbærproduksjon.
Bikal Ghimire (30) er fra Chitwan i Nepal. Han har mastergrad i plantehelse fra universitetene i Gröttingen, Tyskland og Padova i Italia. Under studiet har han vært tilknyttet Institutt for plantevitenskap, Fakultet for biovitenskap, NMBU med økonomisk støtte fra EU-prosjekt Horizon 2020. Hovedveileder har vært Prof. Dr. May Bente Brurberg (NMBU) og med Prof. Dr. Arne Stensvand (NMBU) som medveileder.